膀胱配肾。脾配胃。胆配肝。心配小肠。肺配大肠。心包络配三焦。
卷一
明堂灸经序
铜人针灸经序
太平圣惠方针经序
流注针经序
常山阎明广序
燕山牛良 序
资生经序
赵编序
大德丁未阆中郡蒲登辰序
流注指微针赋
针经标幽赋
流注通玄指要赋
九针论
灸刺论
卷二
论针之名
论三阳三阴经脉
论虚实补泻
论下针分寸
气血问答
经脉统论
骨度统论
离合真邪说
手足三阴三阳表里支干配合
手少阳三焦经手厥阴心包络经直说
络说
络穴说
络穴辨
交经辨
窦太师针灸法流注八穴
八穴交会
定八穴所在
论补泻说
论邪入皮毛经络风冷热灸法
诸病在阴在阳并用针药论
诸阳受气于四肢诸阴受气于五脏论
六节藏象论
诸经贯舌并取廉泉辨
辨陷下则灸
论五脏六腑治证
灸刺禁忌论
奇经八脉论
热病灸刺法论
针经直说
窦汉卿针经气血问答
卷三
九针式
煮针法
折量取穴法
点穴法
孔穴相去法
点灸法
穴名同异
制熟艾法
艾炷大小法
点灸火法
下火法
定灸多少法
用火法
定发际法
论壮数多少法
用针呼吸法
针灸须药
审方书
候天色法
用针略例
灸例
补泻法
灸用火善恶补泻法
迎随补泻法
真言补泻手法
素问泻必用方补必用圆法
春夏刺浅秋冬刺深法
生成数法
手指补泻法
呼吸补泻法
夫妇配合
经络取原法
王海藏拔原法
经络俞穴配合法
十二经是动所生之病
云岐子论经络迎随补泻法
古法流注
四季人神不宜灸
逐日人神歌诀
十二支人神所在诸法
每月血支
避人神等法
旁通十二经络流注孔穴（图）
人神所在不宜针灸
十二部人神不宜灸
十二时忌不宜灸
每月忌日不宜针灸出血
十二部年人神不宜灸
九部旁通人神不宜灸（图）
新忌旁通不宜灸
针禁忌法
针忌
灸禁忌法
甲乙经灸禁穴
杂忌法
天医取师疗病吉日
针灸吉日
十干日不治病
十干日不针灸
推行年医法
求岁天医法
求月天医法
推避病法
推治病法
唤师法
释运气定日下血气法
释流注逐日时开穴法
释流注十二经所属法
释流注十二经动脉原穴所在法
十二经配十二支
十二经配合
论九针孔穴应候诀
手三阴三阳穴流注法
足三阴三阳穴流注法
五脏六腑变化流注出入旁通法
误伤禁穴救针法
骨空穴法
洁古刺诸痛法
治灸疮不发法
淋洗灸疮法
贴灸疮法
忌食物法
卷四
总论
流注经络井荣说
平人气象论经隧周环
手太阴肺之经
手阳明大肠经
足阳明胃经
足太阴脾经
手少阴心经
手太阳小肠经
足太阳膀胱经
足少阴肾经
手厥阴心包经
手少阳三焦经
足少阳胆经
足厥阴肝经
卷五
井荣俞经合部分
十二经脉各至本时刚柔相配内行注穴
五子元建日时歌
五藏六府井荣俞经合
十二经流注五脏六腑明堂
卷六
穴
卷七
卷八
灸膏肓穴法
量同身寸法第一
正坐伸臂法第二
揣骨定穴高下法第三
定穴相去远近法第四
钩股按穴取平法第五
参验求穴法第六
坐点坐灸法第七
石用之取穴别法第八
叶潘等取穴别法第九
灸讫补养法第十
明堂应验小儿灸穴
全婴方灸法
卷九
诸风
中风
中风不语
偏风
风劳
风痉
风眩
风痹
风痫
癫痫
癫疾
惊痫
风癫狂
癫邪
癫痫螈
风疹
历节风
卷十
伤寒
伤寒头痛
伤寒寒热
寒热
伤寒热气
身寒痹
自汗
汗不出
伤寒无汗
伤寒呕哕
疟论
黄胆
卷十一
头风
头痛
脑痛
头旋
头肿
颈项强
面肿
面痛
目痛
目上视
目泪出
目眩
目不明
目翳膜
目赤
青盲
耳鸣
耳痛
耳聋
耳
鼻塞不利
鼻有息肉
鼻涕出
鼻痛
鼻衄
口缓
口喑哑
口眼
口舌干苦
口齿疳疮
唇颊肿痛
舌强
牙痛
齿龋
齿噤
咽喉肿痛
咽喉鸣
咽喉干
喉痹
卷十二
心气
心痛
心恍惚
心惊悸
心喜笑
心忧悲
心烦闷
胆虚
叹息
嗜卧
不卧
梦魇
腹满
胸满
腹胀
心腹坚大
小腹胀满
鼓胀
水肿
脾疼
胃痛
反胃
食不下
不能食
不嗜食
食气
食多
卷十三
虚损
肾虚
劳瘵
梦遗失精
消渴
咳逆上气
少气
咳逆
贲豚气
膀胱气
腹痛
小腹痛
脐痛
膺痛
胸胁痛
膈痛
背痛
肩背酸痛
肩痹痛
臂痛
腋痛
肘痛
脚膝痛
膝痛
腰脚痛
腰痛
腰脊痛
脊痛
骨疼
腠理痛
肠痛
卷十四
喘
咳嗽
肺气
唾血
唾
痰涎
水饮不消
霍乱吐泻
霍乱转筋
呕吐
噫
哕
积聚
积气
癖
疝瘕
疝
手痹
足寒热
足杂病
四肢厥
卷十五
香港脚
脚弱
脚肿
足痹
泻利
溏泄
飧泄
痢
肠鸣
脱肛
肠风
肠
痔漏
便血
淋癃
小便难
小便五色
大便不通
大小便不通
小便不禁
大便不禁
转胞
阴痿缩
阴茎痛
阴汗
阴肿
诸疮肿
癣疥
发背痈疽
瘰
疣目
蛊毒
尸厥中恶
虫兽伤
卷十六
妇人诸疾
妇人血气痛
血块
血崩
月事
赤白带下
难产
产后余疾
乳痈
乳肿痛
阴挺出
绝孕
初生诸疾
惊风
痫病
针灸门
疳病
疟
泄利
目病
大小便病
病
杂病
卷十七
本草药品畏恶
药相反歌
服诸药禁忌
肝脏用药
心脏用药
脾脏用药
肺脏用药
肾脏用药
治风通用药
头面风
中风脚弱
久风湿痹
贼风挛痛
风瘙痒
时气
热病
大热
劳热
劳复
疟病
霍乱
转筋
呕哕
大腹水肿
肠下利
小便淋
小便利
溺血
黄疸
上气咳嗽
肺痿
痰饮
宿食
腹胀满
心腹冷痛
心下满急
虚冷气
心烦
积聚瘕
中恶
鬼疰
尸疰病
惊邪
惊悸
喉痹病
噎病
骨鲠
齿痛
口疮
吐唾血
鼻衄血
鼻壅
鼻肉
目赤热痛
目肤翳
明目
通声
面
发秃落
灭瘢
金疮
折
瘀血
火灼
痈疽
恶疮
漆疮
瘿瘤
疮
五痔
蜇疮
蛇虫
寸白
虚劳
阳萎
阴
囊湿
泄精
好眠
不得眠
诸疼痛
血气
崩中
月闭
无子
安胎
堕胎
产后腹痛
下乳汁
中蛊
出汗
止汗
吐药
卷十八·本草药性异名
玉石部
草部
木部
人部
兽部
禽部
鱼虫部
果部
谷部
菜部
草木类
虫类
玉石类
唐本退十种
本经外草类
卷十八·直音略