大豆及黄卷（恶五参、龙胆，得前胡、乌喙、杏仁、牡蛎良。）
大麦（食蜜为使。）
酱（杀药毒、火毒。）
上一百九十七种，有相制使，其余皆无。
卷第一
孔志约序
梁·陶隐居序
合药分剂料理法
卷第二
诸病通用药
解毒
服药食忌例
凡药不宜入汤酒者
畏恶七情表
玉石上部
玉石中部
玉石下部
草药上部
草药中部
草药下部
木药上部
木药中部
木药下部
兽上部
兽中部
兽下部
虫鱼上部
虫鱼中部
虫鱼下部
果上部
果下部
菜上部
菜中部
米上部
米中部
药对岁物药品
玉石、草、木卷三~十四
卷第三
卷第四
卷第五
卷第六
卷第七
卷第八
卷第九
卷第十
卷第十一
卷第十二
卷第十三
卷第十四
卷第十五
兽上
兽中
兽下
禽上
禽中
禽下
卷第十六
虫鱼上
虫鱼中
虫鱼下
卷第十七
果上
果中
果下
卷第十八
菜上
菜中
菜下
卷第十九
米上
米中
米下
卷第二十
以上（下）草木类及虫鸟等物二十种，陶弘景不识，今医博识人亦不识者