根据古庵而增以通用，各药制法见圈外，其程氏《释药》，出《大观》注、《尔雅》、《博物志》，多从之。
卷首
集例
先天图说
天地人物气候相应说
天地人物气候相应图
释方
历代医学姓氏
原道统说（纂《绀珠经》）
阴骘
保养
运气
内集·卷一 \ 经络
经穴起止
十五络脉
奇经八脉
内集·卷一 \ 脏腑
脏腑总论
脏腑条分
内集·卷一 \ 观形察色问证
观形察色
听声审音
问证
附∶王叔和观病生死候歌
内集·卷一 \ 诊脉
诊脉
寸关尺定位
脏腑定位
七表八里九道脉名
诸脉体状
诸脉相类
诸脉主病
诸脉相兼主病
脏腑六脉诊法
气口人迎脉诀
总看三部脉法
伤寒脉法
杂病脉法
妇人脉法
成童脉法
痈疽脉法
死脉总诀
形色脉相应总诀
内集·卷一 \ 针灸
针灸
子午八法
附∶杂病穴法
禁针穴
造针法
煮针法
灸法
治病要穴
治病奇穴
禁灸穴
炼脐法
针灸禁忌
内集·卷二 \ 本草
本草引（纂雷公）
本草总括
内集·卷二 \ 本草分类
本草分类
治风门
治热门
治湿门
治燥门
治寒门
治疮门
食治门（谷）
食治门（蔬）
食治门（果）
食治门（兽）
食治门（禽）
食治门（鱼）
食治门（粥、酒）
外集·卷三
伤寒序
外感 \ 温暑
伤寒
论六经正病
论表里阴阳汗吐下温解法
论正伤寒名义
论类伤寒名义
论伤寒初证
论伤寒杂证
论传阳变阴之极，变病变法
论瘥证、危证、死证及妇人伤寒。
伤寒用药赋
汗吐下渗和解温补总方
外集·卷三 \ 内伤（饥饱劳役饮食积聚）
内外伤辨
内伤辨（新纂）
脾胃虚实传变论
内伤饥饱劳倦总方
外集·卷四 \ 杂病提纲
丹溪朱先生杂病纂要
外感
内伤
外集·卷四 \ 杂病 \ 外感
头眩
头痛
头风（附眉棱骨痛）
面风
耳
鼻
口舌唇
牙齿
痛风
痹风（附麻木）
斑疹（附赤、白游风）
咳嗽
霍乱
心脾痛
腹痛（附腹中窄狭）
疟
痢
痞满
泄泻
吞酸
黄胆
水肿
鼓胀（与喘参看）
赤白浊
腰痛
疝气
消渴
燥结
胁痛
梦遗
淋
小便不通
小便不禁
脱肛
外集·卷四 \ 杂病 \ 内伤类
伤食
积聚
蛊瘴
气滞
吐血
呕血
衄血
嗽唾咯
溺血
便血
喘
哮
恶心
嘈杂
嗳气
呕吐
呃逆
膈噎
关格
痫
癫狂
惊悸、怔忡、健忘
咽喉（附失音、骨鲠）
发热（附恶寒）
汗
痿
痨瘵
诸虫
求嗣
娠后
养老（附须发）
外集·卷五 \ 妇人门
经候
崩漏
带下
瘕（与男子积聚条参看）
胎前
临产
产后
外集·卷五 \ 小儿门
观形
察脉
五脏形证虚实相乘
死证
乳子调护
外集·卷五 \ 小儿门 \ 附∶小儿病机
初生
撮口
噤口
脐风 （附胎风）
胎惊夜啼
诸惊
客忤
天钓
内钓
变蒸
龟胸龟背（附解颅囟填囟陷滞颐）
五软五硬
丹毒 （附胎疮）
吐泻
五疳
诸积
发热
痘证
麻毒
外集·卷五 \ 外科
痈疽总论
脑发五种 头疮 风屑 白秃 软疖 大头肿 鬓疽 耳疮（附浸淫疮） 月蚀疮 内疳疮 腮 瘰 痰核 瘿瘤
疣 甲疽 代指 天蛇头 鹅掌风 红丝疮
乳痈 肺痈 痿 心痈（附胁痈） 胃痈 肠痈 腹痈
背发七种 腰发二种
臀痈（附臀蛆疮） 便毒 路岐 悬痈（附谷道中疮） 痔漏 阴疮 阴囊痈（附小儿阴囊生疮）妇人阴疮（附交接出血） 附骨疽（附腿上寒湿疮） 杖疮
鹤膝风 人面疮 肾脏风疮 疮 脚跟疮（附脚肚疮及 口疮） 脚发 嵌甲疮 脚指丫疮 脚背发
五疥 五癣 血风疮 癞风 杨梅疮 疔疮 多骨疽 翻花疮 流注 瘭痼 暑热疮 痱痤疮 寒冷疮 冻疮 手足皲 蜗疮 HT 疮 浸淫疮 白蛇缠 汤火疮 肥疮 疣疮 漆疮 竹木刺 折伤 破伤风
外集·卷六
杂病用药赋（一）
杂病用药赋（二）
杂病用药赋（三）
杂病用药赋（四）
杂病用药赋（六）
杂病用药赋（七）
杂病用药赋（八）
杂病用药赋（九）
杂病用药赋（十）
杂病用药赋（十一）
杂病用药赋（十二）
杂病用药赋（十三）
杂病用药赋（十四）
杂病用药赋（十五）
杂病用药赋（十六）
外集·卷七
妇人小儿外科用药赋（一）
妇人小儿外科用药赋（二）
妇人小儿外科用药赋（三）
妇人小儿外科用药赋（四）
妇人小儿外科用药赋（五）
妇人小儿外科用药赋（六）
妇人小儿外科用药赋（七）
妇人小儿外科用药赋（八）
拾遗
杂病妇人小儿外科总方
通用古方诗括
通用古方诗括 \ 伤寒
通用古方诗括 \ 内伤
通用古方诗括 \ 杂病（一）
通用古方诗括 \ 杂病（二）
通用古方诗括 \ 杂病（三）
通用古方诗括 \ 杂病（四）
通用古方诗括 \ 杂病（五）
通用古方诗括 \ 杂病（六）
急救诸方
急救诸方 \ 怪疾
外集·卷七 \ 治法
水火分治
标本分治
标本论
求本论
杂治赋
习医规格
引